常見細(xì)胞污染類型如何辨別及預(yù)防解決方法
常見細(xì)胞污染類型如何辨別及預(yù)防解決方法:細(xì)胞培養(yǎng)中常見的生物污染類型有7種,分別是細(xì)菌污染,支原體污染,原蟲污染,黑膠蟲污染,真菌污染,病毒污染以及非細(xì)胞污染,真菌污染來源,一般是來自實驗服,并且具有氣候性,多雨······
發(fā)布時間:2023-05-08 17:37:53 細(xì)胞資源庫平臺 訪問量:247
全稱:澳大利亞細(xì)胞培養(yǎng)物保藏中心
官網(wǎng):http://www.cellbankaustralia.com/
細(xì)胞查詢鏈接:http://www.cellbankaustralia.com/ecacc-cell-lines
CellBank Australia 是一個由位于悉尼韋斯特米德的兒童醫(yī)學(xué)研究所運營的非盈利組織,是澳大利亞唯一的國家細(xì)胞系儲存庫,為澳大利亞科學(xué)家提供了獲取經(jīng)過驗證的細(xì)胞系和相關(guān)質(zhì)量控制服務(wù)的便捷途徑。
CellBank Australia 還在整個澳大利亞和新西蘭分發(fā)來自英國公共衛(wèi)生部歐洲認(rèn)證細(xì)胞培養(yǎng)物保藏中心 (ECACC) 的細(xì)胞系,這是一個位于英國的主要國際細(xì)胞系儲存庫,以及來自日本研究生物資源保藏中心 (JCRB) 的細(xì)胞系,這兩個集合還包括許多 ATCC 細(xì)胞系。這確保了澳大利亞科學(xué)家可以隨時使用各種經(jīng)過驗證的細(xì)胞系
CellBank Australia 提供多種細(xì)胞系相關(guān)服務(wù),包括 STR 分析、支原體檢測、培養(yǎng)和返回以及安全存儲。
一、細(xì)胞系認(rèn)證測試
細(xì)胞系的交叉污染(一種細(xì)胞系被另一種細(xì)胞系污染)是細(xì)胞培養(yǎng)中的常見問題。1960 年代首次與 HeLa 細(xì)胞系相關(guān)聯(lián),交叉污染在各種研究中估計會影響 13% 到 36% 的現(xiàn)有細(xì)胞系。雖然使用從存儲庫和良好細(xì)胞培養(yǎng)規(guī)范獲得的經(jīng)過驗證的細(xì)胞系可以最大限度地降低交叉污染的風(fēng)險,但它仍然會發(fā)生。因此,研究實驗室定期測試其細(xì)胞系的交叉污染非常重要。
1、人類細(xì)胞系認(rèn)證測試
為什么要進(jìn)行 STR 分析?
認(rèn)證測試旨在確認(rèn)或驗證細(xì)胞系的身份,證明它來自正確的物種和供體。細(xì)胞系可能因交叉污染、錯誤標(biāo)記或其他機制而被錯誤識別。存在超過 450 個錯誤識別的細(xì)胞系,但沒有已知的真實材料。
許多期刊現(xiàn)在要求作者在提交手稿之前驗證細(xì)胞系,并在手稿文本中報告測試。
短串聯(lián)重復(fù) (STR) 分析被用作一致的測試方法,允許實驗室和期刊比較細(xì)胞系樣本。STR 分析是一種基于基因型的方法,用于確定細(xì)胞系是否對應(yīng)于來自同一供體的其他樣本。許多細(xì)胞系沒有其他供體樣本進(jìn)行比較。然而,STR 配置文件數(shù)據(jù)庫可用于排除與 HeLa 和其他經(jīng)典腫瘤細(xì)胞系的交叉污染。
CellBank Australia 的 STR 分析
CellBank Australia 接受細(xì)胞沉淀和 DNA 樣本進(jìn)行測試。
STR 基因座使用 PowerPlex? 16HS 系統(tǒng) (Promega) 進(jìn)行擴增。使用 GeneMapper? ID 軟件 (ThermoFisher) 分析數(shù)據(jù)。
設(shè)施工作人員對測試樣品與參考材料和數(shù)據(jù)庫進(jìn)行全面比較。測試樣品與設(shè)施自己的數(shù)據(jù)集和人類細(xì)胞系 STR 配置文件的國際數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比較。CellBank Australia 的內(nèi)部數(shù)據(jù)集包含來自澳大利亞和新西蘭九年測試細(xì)胞系的 1,500 多個 STR 配置文件。
價格: 每個樣品166美元,不包括消費稅。
2、非人類細(xì)胞系物種鑒定測試
為什么要進(jìn)行物種測試?
認(rèn)證測試旨在確認(rèn)或驗證細(xì)胞系的身份,證明它來自正確的物種和供體。
短串聯(lián)重復(fù)序列 (STR) 分析可以在個體水平上識別細(xì)胞,并已用于人和小鼠細(xì)胞系。其他基于基因型的方法,例如單核苷酸多態(tài)性 (SNP) 分析,可以確定細(xì)胞系的起源菌株。STR 或 SNP 分析尚未針對所有實驗室物種開發(fā),由于近親繁殖,數(shù)據(jù)可能難以解釋。
物種檢測是一種更簡單的方法,可以應(yīng)用于來自許多不同物種的培養(yǎng)細(xì)胞,包括哺乳動物、魚類和昆蟲。該技術(shù)用于檢測種間交叉污染的情況。大約 10% 的已知錯誤識別細(xì)胞系被交叉污染或與來自不同物種的細(xì)胞混合。一種被稱為“DNA 條形碼”的基于序列的方法越來越多地用于物種檢測,并且是細(xì)胞系的新共識方法。
CellBank Australia 的 DNA 條形碼
CellBank Australia 接受細(xì)胞沉淀和 DNA 樣本進(jìn)行測試。
從線粒體基因細(xì)胞色素氧化酶亞基 1 (CO1) 擴增共有區(qū)域用于序列分析。數(shù)據(jù)與幾個序列數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比較,包括 GenBank 和生命條碼數(shù)據(jù)系統(tǒng) (BOLD),其中包含超過 170 萬條公共記錄并涵蓋 176,000 種動物。
價格: 每個樣品150美元,不包括消費稅。
批量測試 8 個或更多樣品可享受 20% 的折扣。
3、支原體檢測
支原體污染細(xì)胞系是細(xì)胞培養(yǎng)中的常見問題。雖然公布的數(shù)字各不相同,但估計 15% 到 35% 的已建立細(xì)胞系被支原體污染。雖然良好的細(xì)胞培養(yǎng)實踐降低了支原體污染的發(fā)生率,但它仍然會發(fā)生,并且很容易傳播。此外,支原體感染可以改變細(xì)胞的各種特性,包括基因活性的變化。由于這些原因,進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng)的研究實驗室必須定期檢測其細(xì)胞系是否存在支原體感染。有關(guān)此問題的更多信息,請參閱 質(zhì)量問題:污染和無菌測試。
為什么要檢測支原體?
術(shù)語“支原體”是指通常存在于細(xì)胞培養(yǎng)物中的一類細(xì)菌。更準(zhǔn)確地稱為軟體菌,這些細(xì)菌缺乏細(xì)胞壁,使它們對常用的抗生素如青霉素產(chǎn)生抗藥性。支原體在細(xì)胞培養(yǎng)過程中很容易通過液滴傳播,并且可以以干燥形式存活數(shù)月。
用顯微鏡很難看到支原體污染,需要進(jìn)行特定測試才能檢測。污染會對實驗工作產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響。根據(jù)存在的物種,支原體生物可以影響細(xì)胞生長、代謝、致瘤性和對化療的反應(yīng)(1, 6-7)。
CellBank Australia 的支原體檢測
對培養(yǎng)基樣品進(jìn)行支原體檢測。我們建議細(xì)胞在不含抗生素的培養(yǎng)基中生長至少兩周和/或至少傳代兩次。采樣前 3-4 天內(nèi)不應(yīng)更換培養(yǎng)基。抗生素可以抑制細(xì)菌污染,這意味著在抗生素中生長的細(xì)胞會增加假陰性結(jié)果的風(fēng)險。
使用靈敏的內(nèi)部 PCR 方法檢測支原體 DNA,并使用內(nèi)部對照檢測 PCR 抑制,這會影響培養(yǎng)樣品。
MycoAlert? 支原體檢測試劑盒 (Lonza) 用作基于酶活性檢測活支原體的第二種方法。
如果結(jié)果不清楚,可以使用第三種測試方法??梢允褂弥甘炯?xì)胞系進(jìn)行富集,導(dǎo)致可能難以在原始測試樣品中檢測到的低水平支原體快速生長。
價格: 每個樣品126美元,不包括消費稅。
CellBank Australia 提供一系列與存款相關(guān)的服務(wù),包括將細(xì)胞系轉(zhuǎn)移到 CellBank Australia 以存儲在我們安全的液氮存儲設(shè)施中。
1、目錄存款
研究科學(xué)家可以通過我們的目錄存入服務(wù)將他們的新型細(xì)胞系存入 CellBank Australia,從而更廣泛地用于研究目的。保藏的細(xì)胞系在供全球分發(fā)之前要經(jīng)過短串聯(lián)重復(fù) (STR) 分析和其他質(zhì)量控制檢查,保藏者無需支付任何費用。
為什么要在 CellBank Australia 存款?
保藏者可以確保從他們的細(xì)胞系中生成 STR 譜,以確保它們確實是獨一無二的。在確定該線路的未來通道是否會受到交叉污染時,這些配置文件是有價值的參考。
存款人可以將感興趣方的細(xì)胞系請求提交給 CellBank Australia 或其分銷合作伙伴。這消除了培養(yǎng)、冷凍和運輸細(xì)胞系的需要,節(jié)省了員工成本和工作量。保藏者還可以通過使用他們保藏的細(xì)胞系來預(yù)期科學(xué)引用的增加。
CellBank Australia 細(xì)胞系的接收者同意在所有引用該材料的出版物和專利申請中承認(rèn)其保藏人(或他們的發(fā)起人,如果不是同一人)。
接收者可以直接從 CellBank Australia 或歐洲認(rèn)證細(xì)胞培養(yǎng)物保藏中心(ECACC;英國)及其渠道合作伙伴和分銷商 Sigma-Aldrich(全球分銷)和 Dainippon Sumito Pharma(DSP;日本)接收 CellBank Australia 的細(xì)胞系. 因此,在 CellBank Australia 位于悉尼的辦公場所之外,CellBank Australia 的細(xì)胞系可從德國、日本、英國和美國的分銷中心獲得。
根據(jù)購買時達(dá)成的協(xié)議條款,細(xì)胞不能用于人體,未經(jīng)保存人同意,不得用于商業(yè)目的。
我們的目錄存放服務(wù)是免費提供的。
2、專利押金
通過我們的專利保藏服務(wù),CellBank Australia 接受人類和動物細(xì)胞系和雜交瘤進(jìn)行儲存,以補充國際專利局對發(fā)明的書面披露。
CellBank Australia 的安全存儲服務(wù)是研究科學(xué)家將與短期或長期異地存儲部分樣本相關(guān)的成本外包的一種方式,作為其主要存儲的備份。該服務(wù)并非旨在取代研究科學(xué)家自己的液氮或 -80°C 冷凍庫。
送往 CellBank Australia 進(jìn)行安全存儲的材料與存儲庫自己的樣本一起保存在三個液氮存儲系統(tǒng)和一個超低溫冰箱中,所有這些系統(tǒng)都連接到一個警報系統(tǒng),可連續(xù)監(jiān)控存儲溫度。停電時,報警系統(tǒng)和存儲系統(tǒng)都連接到備用發(fā)電機。儲存通常低于-150 攝氏度的液氮汽相或低于-80 攝氏度的冰箱。
包含在服務(wù)中
在液氮氣相中儲存,儲存溫度始終低于 -150 攝氏度
或儲存在超低溫冰箱中,儲存溫度始終低于-80攝氏度
每周 7 天,每天 24 小時,通過帶有遠(yuǎn)程警報的建筑物范圍的警報系統(tǒng)監(jiān)控存儲溫度
發(fā)生電源故障時基于發(fā)電機的備用電源系統(tǒng)
定制的、條形碼驅(qū)動的數(shù)據(jù)庫,用于跟蹤具有唯一標(biāo)識號的安瓿。
我們現(xiàn)在提供 10X Chromium 3' 基因表達(dá)服務(wù)。
該服務(wù)包括
細(xì)胞計數(shù)和活力處理
使用 Gel Bead-In Emulsion (GEM) 技術(shù)進(jìn)行細(xì)胞分離和條形碼
后 GEM RT 凈化和 cDNA 擴增
基因表達(dá)文庫構(gòu)建,這種鉻單細(xì)胞基因表達(dá)解決方案使研究人員能夠
識別和表征稀有細(xì)胞類型
分析和了解細(xì)胞異質(zhì)性及其對您的生物系統(tǒng)的影響
評估同一細(xì)胞內(nèi)的 mRNA 和細(xì)胞表面蛋白表達(dá)譜
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